【BOINC】AA作ってる間にがん・たんぱく質を解析 Vol.20【@mona】

1 ：（　´∀｀）さん：2008/02/19(火) 14:34:55 ID:Kj4apQHO0

■■■ UDは終了しました。終了の詳細と移行先は>>2-10の辺り■■■

分散計算処理プロジェクトは、分析計算を世界中のPCで分担して行い
　　　　医療など科学の発展に貢献しようというボランティアです。

つまり 『難病患者を救えたり、未来の科学技術につながる』 って事です

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　　　　　　　　　　　Grid Computing Project Team 2ch
　　　- あなたのCPUの空き時間を科学の発展に貸してください -

　　　　　　　　　　　　　　　Team 2ch 支援サイト
　　　　　　　　　　 〜まだ見ぬ誰かの笑顔のために〜
　　　　　　　　　　　　　　　http://team2ch.info/
　　　　　 　 　 　 　 _＿＿＿_.　　　 ｜　　　　　　　　　　　　 ∧＿∧
　　　　∧,,∧　　　 |｜＼　　 ＼ |￣ |　　point　 ∧＿∧ 　（´<_｀ 　）
　　　 ミ,,ﾟДﾟ彡　　.|｜　 l￣￣ l |：／＼　ゲット （　´_ゝ`）　/　　 ⌒i
　　┌‐ﾐ つつ／￣|｜／.￣￣/／　　　＼　　　／　　　＼/ 　　　|　|
　　 |└ヾ,, ,,|二二二」二二ﾆ. ∧＿∧　 　 ＼ /　　 　/￣￣￣￣/　|
　　　￣||∪∪ 　 |　||　 　 ／（　´∀｀）//￣￣/_ﾆつ/　 FMV　 / .| .|＿
　　―――――――― < 　（ つ　＿// 2ch,/　 > ――――――――
　　 (;　-＿-)＿＿＿＿＿＼ ｛二二｝ 三 三｝ ／＿ ＿＿＿＿
　　/ つ ＿//　　　　　 　 /　＼￣￣￣￣"／..=| ／　　／　｜|　∧∧
　　し'`|＼// ＿Hikkie＿/.　　　＼ 　 　 ／ |.￣ |l￣￣ l　 　 |｜(ﾟДﾟ ,)
　　　　＼｝..二二二二二_｝ 　　　　＼／　　|　＝| ＼￣ ＼　｜|¬ ⊂ ヽ/
　　　２ちゃんねる www.2ch.net 　 ｜　[二二二二二二二|二二二」　　）

◇ 前スレッド　　　　http://love6.2ch.net/test/read.cgi/mona/1187503302/
◇ ガイドライン板　 http://ex20.2ch.net/test/read.cgi/gline/1170141841/

2 ：（　´∀｀）さん：2008/02/19(火) 14:35:39 ID:Kj4apQHO0

■ UDの終了と移行について
Q：UDって終わったの？
A：UDは2007年4月27日に終了となりました。
　　成果や終了に関する情報の翻訳は　http://ud-team2ch.net/
　　新薬の研究・試験・製造には様々なプロセスが必要なため、
　　非常に長い年月がかかります。詳しくは下記
　　http://www.nhk.or.jp/kokokoza/rikasougou/a19/main_5.html

Q：ってことは分散プロジェクトは終了？Team 2chは解散？
A：現在ではほとんどの方がBOINCでWCGと言うプロジェクトなどに移行しています。
　　Team 2chも存在してます。

Q：BOINCって？WCGって？
A：BOINCは現在参加人数世界最大の分散クライアント。
　　特徴としてはUDと違い複数のプロジェクトに参加可能。
　　WCGはその内の医療系プロジェクトです。

Q：なんでBOINCに参加するの？
A：Vista対応やマルチコア対応等BOINCは高性能です。
　　またどんなプロジェクトに参加してもポイントは共通です。
　　つまり、UDのようにある日突然無くなってしまう、という可能性が低いです。

Q：どうやってBOINCでWCGに参加するの？ 英語読めないんだけど・・
A：BOINCは最初のインストールが英語なだけでセットアップや日常での表示は日本語です。
　　画像と日本語で丁寧に説明してるコチラを参照してください
　　Team 2ch Wiki
　　http://team2ch.info/WorldCommunityGrid/
　　世界史板チームサイト
　　http://www.geocities.jp/asamayamanobore/BOINC/boinctop.html

3 ：（　´∀｀）さん：2008/02/19(火) 14:36:01 ID:Kj4apQHO0

■ BOINCのFAQ
Q：自分の板チームに参加したいんだけど・・・
A：自分の板に参加するには、UDと同じく　「名前@板名」　でOKです。

Q：デュアルコアやクアッドコアのCPUやHT（Hyper-Threading Technology）に対応してますか？
A：複数コアやHTに対応しています。最大16コアまでです。

Q：CPUの使用率が100%にならず不安定なんですが
A：シンプルビュー画面でPreferencesをクリック→Use no more than〜を100%に→SAVEをクリック！

Q：CPUの使用率を100%から下げたら不安定になるんですが・・
A：BOINCでCPU使用率を90%以下に設定すると、
　　使用率が数%〜数十%まで大きく変動して不安定になるので、BOINC側は100%に設定して、
　　Battle Encoder Shirase ttp://mion.faireal.net/BES/を使って使用率を絞ったほうが安定するよ。

Q：宿題が完了してるのに送信してくれない？報告待機ってなんだヽ(`Д´)ﾉ
A：宿題の送信は完了したらすぐに行ってます。
　　送信していないように見える「報告待機」の状態は、完了した宿題に関する成績の情報を送信するのを待っている状態。
　　自動的に報告されるので放置でOKです。

Q：いつまでたっても自分のポイントがWCGのサイトで表示されないのですが・・・
A：サイトが更新されるまで最低24時間かかります。宿題の検証でさらに時間がかかることがあります。マターリ待ちましょう

Q：メモリ使いすぎ！
A：WCGならWCGのHPのマイグリッド→デバイスマネージャー→装置プロファイルの、
　　次のスペース以内を使用: % (全メモリーに対する比率) を調節すると、メモリをそれ以上使う宿題が来なくなる。
　　つまり減らしすぎると宿題が全く来なくなるので、様子を見つつ調整する。
　　あとはメモリをあまり使わないプロジェクトのみ参加するとか。

4 ：（　´∀｀）さん：2008/02/19(火) 14:36:15 ID:Kj4apQHO0

Q:Win98では日本語表示されないんだけど
A:http://boinc.baldanders.info/
　　> Windows 98 または Me 上で BOINC Manager をお使いのかたでうまく日本語が表示されない場合は、
　　> BOINC Manager.mo の代わりに BOINC Manager.win98.mo を使ってみてください。
　　> （locale\ja フォルダにコピーする場合は BOINC Manager.mo に名前を変更してください）。
　　> 症状が改善する場合があります。
　　また、もともとlocale\ja フォルダにあったBOINC Manager.moを削除して、
　　BOINC Manager.win98.moを突っ込んでBOINC Manager.moに名前を変えたら、
　　きちんと表示された事例があります。

Q：Windows Vistaで動かせますか？
A：動作は非公認ですが、動作させられます。
　　ただし、一部のケースで動作させられない可能性があります。

Q：MacやLinuxでは参加できないんでしょ？
A：MacやLinuxでもBOINCで参加可能なプロジェクトに参加できます。

Q：PS3（PLAYSTATION 3）では参加できますか？
A：PS3上で動くBOINCで参加可能なプロジェクトには、PS3Gridがあります。
　　PS3GRID Liveなら、Linux導入の知識なしで参加できます。
　　BOINC以外ではPS3製造元SONY公認のFolding@Homeというプロジェクトがあります。

Q：BAMって何？
A：BAM！はそもそも、BOINCクライアントの管理や参加プロジェクト管理を楽にするための支援サイト。
　　BOINCプロジェクトに参加するのに必須ではないです。

5 ：（　´∀｀）さん：2008/02/19(火) 14:36:32 ID:Kj4apQHO0

■ 分散コンピューティングプロジェクト一覧
　　　 　 　 　 　 　 　 　 ┏Help Conquer Cancer（がん解析）
　　　 　 　 　 　 　 　 　 ┣Human Proteome Folding - Phase 2（たんぱく質構造の予測）
　　　 　 　 　 　 　 　 　 ┣Discovering Dengue Drugs - Together（デング熱治療薬開発プロジェクト）
　　　 　 　 　 　 　 　 　 ┣AfricanClimate@Home（アフリカ気象研究）
　　　　 　 .┏WCG━━┻FightAIDS@Home（HIVの新薬開発）
　　BOINC╋TANPAKU（たんぱく質構造の予測）
　　　　 　 .┣Rosetta@home（たんぱく質構造の予測）
　　　　 　 .┣SIMAP（たんぱく質の類似性データベースの構築）
　　　　 　 .┗非医療系━┳QMC@home（モンテカルロ法を用いて量子化学方程式を解く）
　　　　　　　　　　　　　 　 ┗SETI@Home（地球外の知的生命を検出）
　　Folding@Home━Folding@Home（たんぱく質構造の予測・アルツハイマー解析）
　　cellcomputingβirth━CHRONOS（ヒトゲノム染色体間法則性解明）など

　　BOINCの全てのプロジェクト
　　ttp://ja.wikipedia.org/wiki/Berkeley_Open_Infrastructure_for_Network_Computing

■ 各プロジェクト参加の目安
各プロジェクトごとに推奨マシンスペックが違います。PCや解析ソフトの起動時間が短いと
不利なプロジェクトもあるので、参加する際は以下の表を参考にしてください。
　高性能...|　・Climateprediction.net project
　PC向け |
.　　　　 　 |　・AfricanClimate@Home（WCG）
.　　　　 　 |　・FightAIDS@Home（WCG)
.　　　　 　 |　・Human Proteome Folding - Phase 2（WCG)
.　　　　 　 |　・Help Conquer Cancer（WCG)
.　　　　 　 |　・TANPAKU
.　　　　 　 |　
.　　　　 　 |　・SETI@home
.　　　　 　 |　・Rosetta@home
　低性能...|　・Discovering Dengue Drugs - Together(WCG)
　PC向け |　・XtremLab　※現在休止中

6 ：（　´∀｀）さん：2008/02/19(火) 14:36:44 ID:Kj4apQHO0

■ WCG提出結果について
WCG結果状況　https://secure.worldcommunitygrid.org/ms/viewBoincResults.do
宿題の提出状況を確認できる。導入したら確認してちゃんと提出できてるか確認。
妥当性検査処理中は他の人が同じ宿題を提出し、規定数揃うまで続くので数日かかる。
規定数は結果状況ページの宿題名をクリックで出るページのMinimum Quorum。

進行中→妥当性 （宿題を提出したが他の人が同じ宿題を出すまで答え合わせ待ち）
　　　　　 検査処理中.┬→有効 （宿題の結果が正常。通常この場合のみ成績になる）
　　　　　　　　　　　　　├→エラー (クライアント側でエラーが発生。または宿題を捨てた。
　　　　　　　　　　　　　│　　　　　　宿題の不具合で全員エラーなら成績になるようだ。)
　　　　　　　　　　　　　├→遅すぎる (提出期限に間に合わなかった)
　　　　　　　　　　　　　├→無応答 (提出したが答え合わせが期限に間に合わなかった)
　　　　　　　　　　　　　├→不確定┬→有効 （答え合わせの結果が違ってたので確認中
　　　　　　　　　　　　　│　　　　　...│　　　　　確認できたら有効。駄目なら無効)
　　　　　　　　　　　　　├→無効←┘ (宿題の結果が他の人と違ってた)
　　　　　　　　　　　　　└→その他 (何れにも当てはまらない状態)
詳しくは>>1のwikiのWCGのMyGridを参照

■ WCGメンテ時間について
毎日 09:06 から1時間程度. 　　　統計更新 (チーム統計の更新も含む)
毎日 10:00 から30分程度 　　　　BOINCの宿題採点停止
毎日 21:06 から35〜45分程度 　統計更新 (全体と個人統計だけ)
毎日 22:00 から30分程度 　　　　BOINCの宿題採点停止
日曜 17:00 から1時間程度. 　　　UDとWebサイトのデータベースのバックアップ
日曜 18:00 から3時間程度. 　　　BOINCのメンテナンス
つながらない時はﾏﾀｰﾘと待っていてください。

7 ：（　´∀｀）さん：2008/02/19(火) 14:36:57 ID:Kj4apQHO0

■ cell computing βirth
現在、CHRONOSに加えて、スギ花粉飛散経路探索プロジェクト(SPRING)を実施中。
今回のプロジェクトによって得られた結果を解析することにより、より詳細にシミュレーション上での
花粉の挙動が明らかになり、観測データと比較・検討することにより、より高精細な飛散予報を
行うことが可能になると期待しています。

インターネットに繋がるパソコンがあれば、誰でも簡単に参加できます。
もし、興味を持たれましたら、参加方法やプロジェクトの詳細等、下のサイトをご覧下さい。

http://www.cellcomputing.net/simple/index.php

■ Climateprediction.net
Climateprediction.netとはインターネットに繋がっているコンピュータで、
長期的気候予測技術の改善・地球温暖化気温変動調査を行う科学実験です。
無料のプログラムをダウンロードして、データを分析することであなたも参加できます。
WindowsでもMacでもOS/2でもPC-UNIX等でも参加できます。
climateprediction.netとは何か、もう少し詳しく知りたい場合は
ここ↓をみてみるとか。
本家
http://climateprediction.net/

■ Folding@Home
http://folding.stanford.edu/
　目標：タンパク質の折り畳み、凝集およびそれらに関連する病気について理解すること

　タンパク質がどのように自力で組みあがっていくか(折り畳み)をシミュレートし解明するプロジェクトです。
　アルツハイマー病、嚢胞性線維症、BSE(狂牛病)、遺伝型肺気腫などの病気や多くのガンさえもが
　タンパク質が正常に折り畳まれなかった結果だと考えられています。
参加はいたって簡単。
http://folding.stanford.edu/download.html　から各ＯＳ用のクライアントソフトをダウンロードして下さい。
　Windows 98/ME/NT/2000/XP/Vista, Linux(x86/x86_64), Mac OS X(PPC/Intel), PS3 に対応。(FreeBSD/OpenBSDもOK!)
　チーム番号は 162 です。

8 ：（　´∀｀）さん：2008/02/19(火) 14:37:08 ID:Kj4apQHO0

■ WCGの板別集計@404氏
http://wcg-team2ch.no-ip.info/index.html

■ WCGとTANPAKUのTeam 2chチーム内ランキング
cell computing 統計情報（左側メニューの下の方にあります）
http://www5.tok2.com/home/cellrank/

9 ：（　´∀｀）さん：2008/02/19(火) 14:38:22 ID:5kdFSliM0

　 前スレ
　 【BOINC】AA作ってる間にがん・たんぱく質を解析 Vol.19【@mona】
　 ttp://love6.2ch.net/test/read.cgi/mona/1187503302/
■過去ログ
　 【UD】AA作ってる間にがん・たんぱく質を解析モナー Vol.18【@mona】
　 ttp://love6.2ch.net/test/read.cgi/mona/1168787759/
　 【UD】AA作ってる間にがん・たんぱく質を解析モナー Vol.17【@mona】
　 ttp://aa6.2ch.net/test/read.cgi/mona/1149341031/
　 【UD】AA作ってる間にがん・たんぱく質を解析モナー Vol.16【@mona】
　 ttp://aa5.2ch.net/test/read.cgi/mona/1137240931/
　 【UD】AA作ってる間にがん・たんぱく質を解析モナー Vol.15【@mona】
　 ttp://aa5.2ch.net/test/read.cgi/mona/1128436800/
　 【UD】AA作ってる間にがん・たんぱく質を解析モナー Vol.14【@mona】
　 ttp://aa5.2ch.net/test/read.cgi/mona/1115492397/
　 【UD】AA作ってる間にがん・天然痘を解析モナー Vol13【@mona】
　 ttp://aa5.2ch.net/test/read.cgi/mona/1106067130/
　 【UD】AA作ってる間にがん・天然痘を解析モナー Vol12【@mona】
　 ttp://aa5.2ch.net/test/read.cgi/mona/1094903263/
　 【UD】AA作ってる間にがん・天然痘を解析モナー Vol11【@mona】
　 ttp://aa5.2ch.net/test/read.cgi/mona/1082299681/
　 【UD】AA作ってる間にがん・天然痘を解析モナー Vol10【@mona】
　 ttp://aa3.2ch.net/test/read.cgi/mona/1075373172/
　 AA作ってる間にがん・天然痘を解析モナー Vol9
　 ttp://aa3.2ch.net/test/read.cgi/mona/1069402068/
　 AA作ってる間にがん・天然痘を解析モナー Vol8
　 ttp://aa.2ch.net/test/read.cgi/mona/1064636304/
　 白血病解析プロジェクト＠Team2ch @モナ板（実質Vol.7）
　 ttp://aa.2ch.net/test/read.cgi/mona/1043789938/
　 AA作ってる間に白血病を解析モナー Vol6
　 ttp://aa.2ch.net/mona/kako/1031/10310/1031053823.html
　 AA作ってる間に白血病を解析モナー Vol4（実質Vol.5）
　 ttp://aa.2ch.net/mona/kako/1024/10243/1024373898.html
　 AA作ってる間に白血病を解析モナーVol4
　 ttp://aa.2ch.net/mona/kako/1015/10159/1015936958.html
　 AA作ってる間に白血病を解析モナーVol3
　 ttp://choco.2ch.net/mona/kako/1009/10097/1009753154.html
　 AA作ってる間に白血病を解析モナーVol2
　 ttp://choco.2ch.net/mona/kako/998/998818259.html
　 AA作ってる間に白血病を解析モナーVol1
　 ttp://mimizun.com:81/2chlog/mona/piza2.2ch.net/mona/kako/986/986988943.html

10 ：（　´∀｀）さん：2008/02/19(火) 14:38:55 ID:5kdFSliM0

／￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣
|　あなた・・・今落としましたね
＼
　 ￣￣￣|／￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣
　　∧＿∧　　　　　　　／￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣
　 （　・∀・）　∧ ∧ ＜　だからどうした！？
　（　　⊃ ）　 (ﾟДﾟ；)　　＼＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿
￣￣￣￣￣ （つ＿つ＿＿
￣￣￣日∇￣＼| BIBLO |＼
　　　 　 　￣　　　=======　　＼

／￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣
|　そうゆうのは偽善･･・偽善･･･偽善･･･
＼
　 ￣￣￣|／￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣
　　∧＿∧　　　　　　　／￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣
　 （　・∀・）　∧ ∧ ＜　んなこというな！スレに客が来なくなるだろ！
　（　　⊃ ）　 (ﾟДﾟ；)　　＼＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿
￣￣￣￣￣ （つ＿つ＿＿
￣￣￣日∇￣＼| BIBLO |＼
　　　 　 　￣　　　=======　　＼

／￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣
|　まぁ、自己中もほどほどにな
＼
　 ￣￣￣|／￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣
　　∧＿∧　　　　　　　／￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣￣
　 （　・∀・）　∧ ∧ ＜　だから逝ってないでしょ！
　（　　⊃ ）　 (ﾟДﾟ；)　　＼＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿＿
￣￣￣￣￣ （つ＿つ＿＿
￣￣￣日∇￣＼| BIBLO |＼
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